Structure génétique des populations chez les oiseaux de proie, le cas du harfang des neiges

Abstract

Les changements globaux actuels ont des conséquences importantes sur la biodiversité en général et notamment sur la réputation des espèces. La perte d'espèces clés a des impacts majeurs sur le fonctionnement des écosystèmes et peut avoir des répercussions sur les services écosystémiques. La génétique des populations est maintenant un outil primordial dans la conservation et la gestion des populations menacées et offre un large potentiel pour le suivi du statut des rapaces. L'objectif du premier chapitre était d'évaluer l'état de nos connaissances sur la génétique des populations des oiseaux de proie et d'identifier les tendances de publications des études traitant de la structure des populations chez ces espèces. Nous avons également étudié l'influence de la stratégie de migration sur l'émergence d'une structure génétique des populations. Notre revue systématique de la littérature a identifié un manque d'étude sur les espèces se situant dans l'hémisphère sud et sur les espèces avec un statut de conservation élevé (c.-à-d., vulnérable, en danger d'extinction, en danger critique d'extinction). La stratégie de migration au niveau de l'espèce ne semble pas être un facteur déterminant la structure des populations chez les oiseaux de proie. Nous avons aussi observé qu'il est parfois difficile de comparer les études publiées entre elles, puisqu'il n'y a pas toujours de standardisation dans les méthodes et dans les résultats présentés. Nous plaidons pour la standardisation des études génétiques des rapaces afin de mieux contribuer à la gestion et à la conservation de diverses espèces et écosystèmes. Dans le second chapitre, nous nous sommes concentrés sur une espèce en particulier, le harfang des neiges (Bubo scandiacus). Cette espèce extrêmement mobile se reproduit dans la toundra arctique. Durant la période hivernale, le harfang utilise une variété d'environnements, mais semble fidèle à son aire d'hivernage. Malgré son statut de conservation vulnérable et un récent déclin suspecté des populations, il y a très peu d'informations sur la génétique des populations chez cette espèce. L'objectif du deuxième chapitre était d'élucider la structure de population du harfang des neiges sur les aires d'hivernage. Cent-cinquante individus ont été échantillonnés le long d'un gradient est-ouest de 4 000 km en Amérique du Nord et ont été génotypés pour 5 987 SNPs. Nos résultats indiquent que les harfangs des neiges d'Amérique du Nord appartiennent à une seule population panmictique. En revanche, nous avons détecté un gradient longitudinal de la diversité génétique individuelle: les individus à l'ouest du continent présentent une hétérozygotie moyenne plus élevée que les individus qui se retrouvent à l'Est. La taille efficace de population (Ne) a été évaluée à 20 253 individus (intervalle de confiance statistique à 95%: 14 729-32 387). Nos analyses démographiques suggèrent que la taille efficace est en diminution depuis 6 000 ans, probablement reliée aux périodes de réchauffements du climat. Cette thèse a permis d'obtenir une vision synthétique de nos connaissances sur la structure génétique des populations des rapaces (Chapitre I) et de combler certaines lacunes sur la génétique des populations chez le harfang des neiges (Chapitre II). Mots-clés: oiseaux de proie, conservation, diversité génétique, harfang des neiges.